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甲基化測序:捕捉三陰性乳腺癌表觀遺傳特性

2018-05-22 來源:解碼醫(yī)學(xué)  標(biāo)簽: 掌上醫(yī)生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護(hù)膚
摘要:目前并沒有可靠的方法來對上述兩類三陰性乳腺癌進(jìn)行區(qū)分,而臨床醫(yī)生往往依據(jù)腫瘤的尺寸、擴(kuò)散程度以及淋巴結(jié)的滲透性來決定患者應(yīng)該被分為高風(fēng)險(xiǎn)類還是低風(fēng)險(xiǎn)類中。

近日,一篇刊登在國際雜志NatureCommunications上的研究報(bào)告中,來自澳大利亞悉尼加文醫(yī)學(xué)研究所(GarvanInstituteofMedicalResearch)的科學(xué)家們通過將乳腺癌患者機(jī)體的乳腺癌甲基化組同健康個(gè)體進(jìn)行比較從而繪制出了一種新型的基因組圖譜,其可以幫助揭示DNA如何被甲基化基團(tuán)進(jìn)行修飾,即DNA的甲基化過程。

本文研究揭示了乳腺癌細(xì)胞主要活檢組織中不同的甲基化模式,其可以有效揭示患者的預(yù)后情況;三陰性乳腺癌在所有乳腺癌中占到了15%至20%,患該類乳腺癌的患者相比其它乳腺癌患者的復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)和死亡率都較高;三陰性乳腺癌患者往往分為兩類:第一類是不管是否進(jìn)行治療患者在3-5年內(nèi)就會(huì)死亡;第二類是平均比非三陰性乳腺癌患者存活時(shí)間更長的患者群(在診斷后至少可以存活8年)。

目前并沒有可靠的方法來對上述兩類三陰性乳腺癌進(jìn)行區(qū)分,而臨床醫(yī)生往往依據(jù)腫瘤的尺寸、擴(kuò)散程度以及淋巴結(jié)的滲透性來決定患者應(yīng)該被分為高風(fēng)險(xiǎn)類還是低風(fēng)險(xiǎn)類中。SusanClark教授說道,文章中我們對三陰性乳腺癌患者的組織樣本和配對的正常樣本進(jìn)行全基因組甲基化捕捉測序,同時(shí)進(jìn)行新一代的測序來確定癌癥在DNA甲基化中的特異性改變。

這項(xiàng)研究首次調(diào)查了三陰性乳腺癌的甲基化組及其和疾病預(yù)后的關(guān)聯(lián)情況,目前在進(jìn)行該疾病的有效管理上仍然缺乏相關(guān)的依據(jù),由于缺少強(qiáng)大的檢測診斷工具,很多女性都存在治療過度的情況。研究者指出,根據(jù)腫瘤的表觀遺傳特性對其進(jìn)行分類,我們就可以隨著時(shí)間對選擇性的乳腺癌群體進(jìn)行追蹤,及時(shí)監(jiān)測患者對不同療法的反應(yīng)情況。

目前研究者ClareStirzaker及其同事開發(fā)出的新型方法可以對歸檔的組織進(jìn)行DNA提取來對甲基化組進(jìn)行測序,從而實(shí)現(xiàn)將患者的甲基化模式同其疾病預(yù)后相聯(lián)系起來。開發(fā)一種甲基化的測序技術(shù)也可以幫助研究者進(jìn)行更多深入的研究。最后研究者表示,本文研究或?yàn)楹笃陂_發(fā)乳腺癌的新型診斷工具提供一定的幫助和線索。

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