初以諸生貢太學。后棄去，往來吳淞、震澤，專以醫(yī)活人。大樁著書頗多，有《蘭臺軌方》、《醫(yī)舉源流》、《論傷寒類方》等，都為醫(yī)學之籍。他的歌曲有《洄溪道情》三十余首，《中國詩史》頗多罵世之語。祖父除釚，康熙十八年1679鴻詞科翰林，任檢討職，纂修明史。父徐養(yǎng)浩，精水利之學，曾聘修《吳中水利志》。大椿白幼習儒，旁及百家，聰明過人。年近三十，因家人多病而致力醫(yī)學，攻研歷代名醫(yī)之書，速成深邃。懸壺濟世，洞明藥性，雖至重之疾，每能手到病除。

　　徐大椿精勤于學，平生著述甚豐，皆其所評論闡發(fā)，如《醫(yī)學源流論》1757、《醫(yī)貫砭》1767、《蘭臺軌范》1764《慎疾芻言》1767等，均能一掃成見，另樹一幟，實中醫(yī)史上千百年獨見之醫(yī)學評論大家。又著《難經經釋》1727，《神農本草經百種錄》1736、《傷寒類方》(1759)及《內經詮釋》、《六經病解》等，雖曰遵經詮釋之作，其中真知灼見亦頗不少。后人將其所著輯為《徐氏醫(yī)學全書十六種》等板行，流傳甚廣影響極大。

　　徐大椿曾兩度奉詔赴京。首次為乾隆二十五年1760，直言質樸而得乾隆帝嘉賞，原擬留職京師，堅辭放歸隱居畫眉泉;第二次乾隆三十六年，年已七十九歲，自知不豫，攜子徐爔同行，到京后三日死。死前自擬墓前對聯曰：“滿山芳草仙人藥，一徑清風處士墳，”可謂平生寫照云。