潛伏期一般為1～2周，可短至4天，長(cháng)達1年以上。起病突然或隱匿，可有以下臨床類(lèi)型。
1.無(wú)癥狀型(原蟲(chóng)攜帶狀態(tài)) 大多數糞便內能找到阿米巴原蟲(chóng)而無(wú)癥狀，包囊僅在常規糞檢中發(fā)現，并在整個(gè)感染期間排出，作為共居者存在，不侵襲組織，這類(lèi)患者約90%為迪斯帕內阿米巴感染。但也有極少數感染溶組織內阿米巴而癥狀不明顯，多年保持亞臨床狀態(tài)如腹部不適、氣脹、便秘等。
2.普通型 起病一般緩慢，有腹部不適，大便稀薄，有時(shí)腹瀉，每天數次，有時(shí)亦可便秘。腹瀉時(shí)大便略有膿血，呈痢疾樣。如病變發(fā)展，痢疾樣大便可增至10～15次/d或以上，伴有里急后重，腹痛加劇和腹脹。回盲部、橫結腸及直腸部均可有壓痛。全身癥狀較輕微，常有低熱或不發(fā)熱。上述癥狀一般持續數天至數星期，可自行緩解，如未接受治療則易于復發(fā)。糞檢可有少量或多量滋養體，大便有腐敗腥臭。
3.暴發(fā)型 此型少見(jiàn)，多發(fā)生于體弱和營(yíng)養不良者。起病急驟，中毒癥狀顯著(zhù)，重病容，有高熱及極度衰竭。大便迅速增至15次/d以上，含明顯膿血與大量滋養體，甚至肛門(mén)失禁，呈水樣或血水樣，有奇臭，伴嘔吐、劇烈腹痛、里急后重及腹部明顯壓痛。患者有不同程度脫水與電解質(zhì)紊亂，有時(shí)可出現休克，易并發(fā)腸出血與腸穿孔。如不積極搶救，可于1～2周內因毒血癥或并發(fā)癥而死亡。
4.慢性型 常為普通型未經(jīng)徹底治療的延續，病程可持續數月甚至數年不愈。腹瀉反復發(fā)作，或與便秘交替出現。一般腹瀉每天不超過(guò)3～5次，大便呈黃糊狀，帶少量黏液及血液，有腐臭，常伴有臍周或下腹部疼痛。癥狀可持續存在，或有間歇。間歇期長(cháng)短不一，可為數星期或數月。間歇期間可無(wú)任何癥狀，常因疲勞、飲食不當、暴飲暴食及情緒變化等為復發(fā)的誘因。久病者常伴有貧血、乏力、消瘦、肝大及神經(jīng)衰弱等。易并發(fā)闌尾炎及肝膿腫。大便檢查可找到滋養體或包囊。
典型阿米巴痢疾診斷不難，確診有賴(lài)于糞便中找到病原體。不典型病例往往需借助結腸鏡檢查、血清學(xué)檢查及診斷性治療等措施。
1.臨床癥狀 一般起病較慢，中毒癥狀較輕，痢疾樣腹瀉次數較少，有果醬樣大便，容易反復發(fā)作。由于其癥狀輕重不一，且缺少特征性，故對慢性腹瀉或有含糊不清的腸道疾病者，應考慮有本病可能。
2.實(shí)驗室檢查 糞便檢查是確診的重要依據。發(fā)現病原體后尚須鑒別非致病性阿米巴原蟲(chóng)。目前血清學(xué)檢查發(fā)展很快，是診斷阿米巴病的關(guān)鍵性實(shí)驗，大約有90%的患者血清，可通過(guò)ELISA、間接血凝及間接免疫熒光等檢測不同滴度的抗體。PCR診斷技術(shù)為十分有效、敏感及特異的方法。WHO專(zhuān)門(mén)委員會(huì )建議，鏡下檢獲含四核的包囊，應鑒定為溶組織內阿米巴或迪斯帕內阿米巴;糞中檢測含紅細胞的滋養體，應高度懷疑為溶組織內阿米巴;血清學(xué)檢查高滴度陽(yáng)性，應高度懷疑為溶組織內阿米巴感染。阿米巴病僅由溶組織內阿米巴引起。
3.結腸鏡檢查 對那些顯微鏡檢查、血清學(xué)及PCR檢查均未獲陽(yáng)性結果，而臨床高度懷疑的病例，可行結腸鏡檢查或纖維腸鏡檢查。約2/3有癥狀病例中，直腸和乙狀結腸黏膜可見(jiàn)大小不等的散在潰瘍，表面覆有黃色膿液，邊緣略突出，稍充血，潰瘍與潰瘍之間的黏膜正常。從潰瘍面刮取材料作鏡檢，發(fā)現滋養體機會(huì )較多。
4.X線(xiàn)鋇劑灌腸檢查 病變部有充盈缺損、痙攣及壅塞現象。此種發(fā)現雖無(wú)特異性，但有助于阿米巴瘤與腸癌的鑒別。
5.診斷性治療 如臨床上有高度懷疑而各種檢查又不能確診時(shí)，可選用抗阿米巴藥物治療，如效果確切，診斷亦可成立。

應與下列疾病相鑒別：
1.細菌性痢疾 鑒別。
2.血吸蟲(chóng)病 有疫水接觸史，肝脾大、血嗜酸性粒細胞增高，大便毛蚴孵化、直腸黏膜活檢蟲(chóng)卵及環(huán)卵沉淀試驗或循環(huán)抗原檢測等陽(yáng)性可資鑒別。
3.結腸癌 一般年齡較大，排便習慣改變并有不暢感。糞便變細且含血液，有漸進(jìn)性腹脹。肛指檢查、X線(xiàn)鋇劑、結腸鏡檢查等有助于鑒別。
4.非特異性潰瘍性結腸炎 左側痙攣性疼痛，內鏡檢查可見(jiàn)結腸黏膜廣泛充血、水腫，潰瘍多而易出血，多次病原體檢查陰性，血清免疫學(xué)試驗阿米巴抗體陰性，抗阿米巴診斷性治療無(wú)效等可作出診斷。