(一)腸道并發(fā)癥：
1、腸穿孔：急性腸穿孔多發(fā)生于嚴重的阿米巴腸病患者，此系腸阿米巴病威脅生命最嚴重的并發(fā)癥，穿孔可因腸壁病變使腸腔內容物入腹腔釀成局限性或彌漫性腹膜炎，穿孔部位多見(jiàn)于盲腸、闌尾和升結腸。慢性穿孔先形成腸粘連，爾后常形成局部膿腫或穿入附近器官形成內瘺。
2、腸出血：發(fā)生率少于1%，一般可發(fā)生于阿米巴痢疾或肉芽腫患者，因潰瘍侵及腸壁血管所致。大量出血每因潰瘍達于粘膜下層，侵襲大血管，或肉芽腫破壞所致。大量出血雖少見(jiàn)，但一旦發(fā)生，病情危急，常因出血而致休克。小量出血多由于淺表潰瘍滲血所致。
3、闌尾炎：因阿米巴腸病好好于盲腸部位，故累及闌尾的機會(huì )較多，結腸阿米巴病尸檢中發(fā)現6.2%～40.9%有闌尾炎，國內報告，累及闌尾者僅0.9%。其癥狀與細菌性闌尾炎相似，亦有急、慢性等表現，但若有阿米巴痢疾病史并有明顯右下腹壓痛者，應考慮本病。
4、阿米巴瘤：腸壁產(chǎn)生大量肉芽組織，形成可觸及的腫塊。多發(fā)生在盲腸，亦見(jiàn)于橫結腸、直腸及肛門(mén)，常伴疼痛，極似腫瘤，不易與腸癌區別。瘤體增大時(shí)可引起腸梗阻。
5、腸腔狹窄：慢性患者，腸道潰瘍的纖維組織修復，可形成疤痕性狹窄，并出現腹部絞痛、嘔吐、腹脹及梗阻癥狀。
6、肛門(mén)周?chē)⒚装筒。涸摬≥^少見(jiàn)，在臨床上常誤診。當有皮膚損傷或肛裂、肛管炎及隱窩炎等病變時(shí)，阿米巴滋養體即可直接侵入皮膚內而引起肛門(mén)周?chē)⒚装筒。袝r(shí)病變可繼發(fā)于掛線(xiàn)法治療痔瘺之后，阿米巴滋養體偶可通過(guò)血行感染肛門(mén)周?chē)M織，出現粟粒樣大小棕色皮疹，其疹扁平隆起，邊緣不清，最后形成潰瘍或膿腫，破裂后排出膿液及分泌物。易被誤診為直腸肛管癌、基底細胞癌或皮膚結核等。
(二)腸外并發(fā)癥：阿米巴滋養體可自腸道經(jīng)血流一淋巴蔓延遠處器官而引起各種腸外并發(fā)癥，其中以肝膿腫為是常見(jiàn)，其次如肺、胸膜、心包、腦、腹膜、胃、膽囊、皮膚、泌尿系統、女性生殖系統等均可侵及。