最近，來(lái)自美國幾所主要大學(xué)和俄羅斯ITMO大學(xué)的研究人員，在肺癌細胞中發(fā)現了一些新的驅動(dòng)突變（drivermutations），可能用于基因靶向治療和免疫治療。相關(guān)研究結果發(fā)表在最新一期的《NatureGenetics》雜志。

在超過(guò)1000名肺癌或鱗狀細胞癌患者中，研究者對他們的腫瘤外顯子組序列進(jìn)行研究發(fā)現，兩種常見(jiàn)肺癌亞型都含有體細胞突變和抗原特性，這可能會(huì )用于靶向治療或免疫治療。

美國和俄羅斯的研究人員在《NatureGenetics》中聲稱(chēng)，他們對660名肺癌患者和484名鱗狀細胞癌患者進(jìn)行了腫瘤樣本和正常樣本外顯子組測序，基于陣列的拷貝數型分析和免疫原性預測。

在這個(gè)過(guò)程中，該團隊檢測到了很多顯著(zhù)突變基因，但只有極少數突變基因在兩個(gè)肺癌亞型中重復出現。這表明靶向的治療需要隨著(zhù)亞型的不同而改變。每個(gè)腫瘤亞型中大約一半腫瘤會(huì )表達幾種不同的抗原決定簇，而這些抗原決定簇有利于免疫治療。

JoshuaCampbell在一份報告中說(shuō)，他們已經(jīng)確認了幾種不同的復發(fā)突變。這些突變可能會(huì )被免疫系統識別，因此他們將可能是腫瘤疫苗強有力的“候選人”。

Campbell和同事利用安捷倫SureSelect外顯子組包來(lái)捕獲腫瘤和正常肺癌樣本的蛋白質(zhì)編碼區域，然后通過(guò)Illumina雙末端配對序列進(jìn)行測序。他們使用統計方法檢測潛在的癌癥“司機”突變（drivermutations），并通過(guò)比對正常樣本數據和近3000名正常外顯子組來(lái)過(guò)濾“乘客”突變（passengermutations）。

結果表明兩個(gè)癌癥亞型之間的顯著(zhù)突變基因譜不同，每種亞型都含有與吸煙有關(guān)的突變標記（mutationsignatures）。

Campbell說(shuō)：“我們需要進(jìn)一步研究是什么導致基因突變，這種突變會(huì )導致某種細胞不受控制地生長(cháng)，而對另一種細胞無(wú)影響。這方面的知識將幫助我們更好地理解腫瘤生長(cháng)的分子通路，并幫助我們設計出更好的藥物。”

該團隊發(fā)現肺癌中高突變的38個(gè)基因，這其中包括PPP3CA，DOT1L和FTSJD1等疾病的以往研究中未曾發(fā)現的幾個(gè)突變基因。對于肺鱗狀細胞癌，他們發(fā)現了20種顯著(zhù)突變基因，包括RASA1。在此之前，一直沒(méi)有人發(fā)現RASA1與這種亞型之間的聯(lián)系。

11處局部放大峰和13處局部刪除峰表明，兩種肺癌亞型都發(fā)現了六種顯著(zhù)突變基因。但是大多數峰都是特定于某一個(gè)腫瘤亞型的。

在過(guò)去的研究中，受體酪氨酸激酶突變在肺癌中非常普遍。但是研究人員發(fā)現，在沒(méi)有酪氨酸激酶受體改變的腫瘤亞型中，基因如SOS1，VAV1，RASA1和ARHGAP35突變會(huì )非常普遍。

總體而言，鱗狀細胞癌與身體其他部位的癌，如膀胱癌，吸煙相關(guān)的上皮癌，以及頭頸部鱗狀細胞癌共享更多的分子特征。

最后，該團隊在47％的肺癌和53％的鱗狀細胞癌中，發(fā)現了五個(gè)抗原決定簇。

Campbell說(shuō)：“一些高復發(fā)的基因突變可以產(chǎn)生抗原決定簇，未來(lái)的研究可能會(huì )進(jìn)一步揭開(kāi)免疫抑制劑和個(gè)性化疫苗的臨床表現與這些抗原決定簇之間的關(guān)系。”