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DNA甲基化標(biāo)志物:預(yù)測(cè)胃癌

2018-05-24 來(lái)源:基因谷  標(biāo)簽: 掌上醫(yī)生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護(hù)膚
摘要:特殊標(biāo)志物,比如ELMO1在兩個(gè)患者組都表現(xiàn)出高識(shí)別率。然而,其它標(biāo)記,包括ARHGEF4,由于橫跨正常組和患者組的背景,識(shí)別率更具多樣。

美國(guó)胃腸病學(xué)院提交的一項(xiàng)研究新研究表明,在美國(guó)和韓國(guó)的隊(duì)列中,多個(gè)甲基化DNA標(biāo)志物可以準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)胃癌

“在這項(xiàng)研究中,我們通過(guò)全甲基化測(cè)序鑒定了新的甲基化DNA標(biāo)志物,隨后在美國(guó)和南韓的患者隊(duì)列中確認(rèn)了最佳候選,”Bradley W.Anderson博士(梅奧診所)在演講中提到。

來(lái)自美國(guó)35名患者和韓國(guó)50名患者的17份甲基化DNA標(biāo)志物候選具有完整的腺癌,Anderson和同事們對(duì)其進(jìn)行了評(píng)估,并與對(duì)照組進(jìn)行比較。美國(guó)組是與65名健康患者的正常胃黏膜上皮細(xì)胞對(duì)比。50名韓國(guó)患者在首爾大學(xué)醫(yī)院接受治療,作為自身對(duì)照組。據(jù)Anderson所說(shuō),在基線(xiàn)時(shí)取鄰近的正常粘膜做樣本。

對(duì)每一個(gè)標(biāo)記物,應(yīng)用邏輯回歸分析計(jì)算曲線(xiàn)下面積(AUC)。來(lái)自顯微組織的DNA是通過(guò)甲基化特異性聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)進(jìn)行分析,通過(guò)β肌動(dòng)蛋白對(duì)標(biāo)志物水平標(biāo)準(zhǔn)化。

研究人員發(fā)現(xiàn),前10位的DNA標(biāo)記包括ARHGEF4,ELMO1,ABCB1,CLEC11A,ST8SIA1,SFMBT2,CD1D,CYP26C1,ZNF569和C13ORF18。

這10個(gè)標(biāo)志物檢測(cè)出美國(guó)組胃癌率為100%,南韓檢測(cè)率為94%,其特異性為95%。

美國(guó)隊(duì)列各標(biāo)志物的AUCs分別為ARHGEF4:0.92;ELMO1:0.91;ABCB1:0.89;CLEC11A:0.88;ST8SIA1:0.85;SFMBT2:0.82;CD1D:0.82;CYP26C1:0.81;ZNF569:0.75;C13ORF18:0.66。

南韓隊(duì)列各標(biāo)記的AUCs分別為ARHGEF4:0.73;ELMO1:0.9;ABCB1:0.78;CLEC11A:0.75;ST8SIA1:0.8;SFMBT2:0.94;CD1D:0.87;CYP26C1:0.79;ZNF569:0.75;C13ORF18:0.79。

“這些標(biāo)志物準(zhǔn)確性高,而且一些標(biāo)記在兩組的判別中相似,”Anderson說(shuō)。

特殊標(biāo)志物,比如ELMO1在兩個(gè)患者組都表現(xiàn)出高識(shí)別率。然而,其它標(biāo)記,包括ARHGEF4,由于橫跨正常組和患者組的背景,識(shí)別率更具多樣。

“在美國(guó)組和南韓組中,研究人員鑒定出對(duì)胃癌具有高敏感性和特異性的有益甲基化DNA標(biāo)志物,Anderson總結(jié)說(shuō)。“將這些候選甲基化DNA標(biāo)志物批準(zhǔn)用于早期胃癌,還需要進(jìn)一步研究。”

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