本病治療關(guān)鍵在于積極控制感染、防止復發(fā)、支除誘因、糾正先天或后天尿路結構異常，防止腎功能損害。
1、一般治療 急性感染時(shí)應臥床休息，多飲水，勤排尿，減少細菌在膀胱內停留時(shí)間。女孩應注意外陰部清潔，積極治療蟯蟲(chóng)。
2、抗菌療法 應早期積極應用抗菌物治療。藥物選擇一般根據：①感染部位：對腎盂腎炎應選擇血濃度高的藥物，而下尿路感染則應選擇尿濃度高的藥物如呋喃類(lèi)或磺胺；②尿培養及藥物敏感結果；③腎損害少的藥物。急性初次感染經(jīng)以下藥物治療，癥狀多于2～3天內好轉、菌尿消失。如治療2～3天癥狀仍不見(jiàn)好轉或菌尿持續存在，多表明細菌對該藥可能耐藥，應及早調整，必要時(shí)可兩種藥物聯(lián)合應用。
(1)磺胺藥：因其對大多數大腸桿菌有較強抑菌作用，尿中溶解度高，不易產(chǎn)生耐藥性，價(jià)格便宜常為初次感染首選藥物。常用制劑為磺胺甲基異惡唑（SME），多與增效劑甲氧芐氨嘧啶（TMP）聯(lián)合應用（即復方新諾明SMZco）。其劑量為50mg/(kg·d)分2次服。一般療程為1～2周。為防止在尿中形成結晶應多飲水，腎功能不全時(shí)慎用。
(2)吡哌酸（pipemidic acid,PPA）：對大腸桿菌引起的尿感，因其尿排出率高，療效顯著(zhù)。適用于各種類(lèi)型尿感。用量30～50mg/(kg·d)，分3～4次口服。副作用少，可用輕度胃部不適。幼兒慎用。
(3)呋喃坦啶：抑菌范圍廣，對大腸桿菌效果顯著(zhù)，不易產(chǎn)生耐藥性。劑量為8～10mg/(kg·d)，分3次口服。易致胃腸反應，農宜在飯后服用。亦可配合TMP使用。對頑固性感染需3～4個(gè)月連接治療時(shí)更宜選用呋喃坦啶。
(4)氟哌酸；為喹諾酮類(lèi)全合成廣譜抗菌藥物，對革蘭陰性、陽(yáng)性菌增色有較強抗菌作用。劑量5～10mg/(kg·d)，分3～4次口服。因其抗菌作用較強，長(cháng)期應用可導致菌群失調，使用時(shí)應注意。一般不用于幼兒。
(5)氨基芐青霉素、先鋒霉素：均為廣譜抗生素，有較好抑菌作用，常用于尿感的治療。卡那霉素、慶大霉素雖有較好抑菌作用，但因其腎霉性較大，且對聽(tīng)力也有不良影響，使用時(shí)應慎重。
3、療程問(wèn)題 急性感染時(shí)如所選用抗生素對細菌敏感，一般10天療程可使絕大多數病人感染得到控制，如不伴發(fā)熱者5天療程可能已足夠。痊愈后應定期隨訪(fǎng)年或更長(cháng)。因為多數再發(fā)是再感染所致，因此不主張對所有病人均采用長(cháng)程療法。具體建議如下：①對不經(jīng)常再發(fā)者，再發(fā)后按急性處理；②反復再發(fā)者，急性癥狀控制后可用SMZco、呋喃坦啶、吡哌酸或氟哌酸中的一種小劑量（治療量的1/3～1/4）每晚睡前服用1次，療程可持續3～6個(gè)月。對反復多次感染或腎實(shí)質(zhì)已有不同損害者，療程可處長(cháng)至1～2年。為防止耐藥菌株產(chǎn)生，可采用聯(lián)合用藥或輪替用藥，即每種藥物用2～3周后輪換使用，以提高療效。
4、積極治療尿路結構異常 小兒尿路感染約半數可伴有各種誘因，特別在慢性或反復再發(fā)的尿感多同時(shí)伴有尿路結構異常，必須積極查找，盡早治療，防止腎實(shí)質(zhì)損害。