根據梗阻性黃疸、肝腫大、門(mén)脈高壓等臨床表現；血清ALT、AST及堿性磷酸酶升高；膽囊造影不顯影；汗液中氯化物增加及肝活檢異常可以確立診斷。
1.嬰兒期可有梗阻性黃疸，可在生后3周內發(fā)生，持續20～180日，可伴有小腸閉鎖、腸扭轉，粘稠的膽汁淤積是導致肝外阻塞的原因。囊性纖維化可伴有梗阻性黃疸、新生兒肝炎，肝細胞變形成巨大細胞。部分嬰兒可完全緩解，部分可死于肝衰竭和其人了合并癥。如有胎糞性回腸梗阻病史則應考慮本病。
2.2%～16%囊性纖維化患者出現肝病相關(guān)癥狀，如門(mén)脈高壓癥的上消化道出血或脾腫大。有肝功能不全的表現。另外，可有肝腫大及生長(cháng)遲緩。
某些患者可有膽石癥和膽囊炎，15%患者膽囊微小，25%幾乎看不到膽囊。8%有膽結石。膽道疾病可能與膽道異常分泌物沉積或膽汁成分異常而致膽汁沉積、阻塞膽道有關(guān)。

與其它胰腺疾病鑒別。