兩型錐蟲(chóng)病的病情嚴重程度及發(fā)展過(guò)程均有所不同。如岡比亞型感染后多無(wú)癥狀，可持續數月甚至幾年，此階段約半數有頸淋巴結病。初期多無(wú)“下疳”。淋巴血液期癥狀輕。腦膜腦炎出現較晚，進(jìn)展緩慢。羅得西亞型潛伏期為2～3周。發(fā)病急，病情重，多有急性中毒癥狀，如發(fā)熱高，消瘦明顯，迅速衰竭，并有繼發(fā)感染或心肌炎等。但淋巴結病較輕。自然過(guò)程常于6～9個(gè)月以?xún)人烙诙狙Y。腦膜腦炎可發(fā)生在早期，且進(jìn)展迅速，但也有典型的睡眠病癥狀,尚未出現即死亡者。錐蟲(chóng)病按病程分三期：
1.初期 被感染性采采蠅叮咬2～3天后，局部皮膚紅腫，伴疼痛及壓痛，質(zhì)地較硬，即錐蟲(chóng)性“下疳”，其直徑約3～10cm，形成潰瘍者罕見(jiàn)。經(jīng)常有局部淋巴結腫大。“下疳”經(jīng)2～4周后自行消散。擠壓“下疳”，在擠出的水腫液中，有時(shí)可查見(jiàn)錐蟲(chóng)。只是在此階段就醫者甚少。
2.淋巴血液期(錐蟲(chóng)血癥期，Ⅰ期) 潛伏期一般為10天至3周，個(gè)別病例可長(cháng)達5年。錐蟲(chóng)經(jīng)淋巴系統進(jìn)入血液循環(huán)時(shí)，可出現不規則或間歇型高熱，伴隨劇烈的進(jìn)行性頭痛、乏力、皮膚瘙癢、肌痛和關(guān)節痛;以及進(jìn)行性淋巴結腫大，可為局限性或全身性。岡比亞型多見(jiàn)于頸部，特別是頸后三角區，稱(chēng)Winterbottom征，羅得西亞型以鎖骨上、腋窩與腹股溝等處為多，其部位不同可能與不同采采蠅叮咬習慣不同有關(guān)。腫大淋巴結直徑為1～2cm，柔軟無(wú)壓痛，能活動(dòng)，一般為多發(fā)。
發(fā)熱期持續1周或更長(cháng)時(shí)間后即間歇，隨著(zhù)錐蟲(chóng)抗原變異，產(chǎn)生免疫逃避而使發(fā)熱定期再起。此期蟲(chóng)血癥明顯。發(fā)熱可以很輕，特別是岡比亞型。暫時(shí)性皮疹可見(jiàn)于膚色淺的患者，多見(jiàn)于胸背及上腹部。一般在發(fā)病后6～8周出現，呈卵圓、環(huán)形，淡紅色，數日后消退。隨著(zhù)疾病的進(jìn)展，發(fā)熱漸少，至晚期則極罕見(jiàn)。在此期間可出現不同器官的損傷，如致命性的心肌炎，以羅得西亞型為突出。脾臟中等度腫大者約占25%～50%，肝可腫大并有血清AST與ALT升高。患者易發(fā)生繼發(fā)性支氣管肺炎。也可有虹膜睫狀體炎、視神經(jīng)萎縮、周期性腹瀉，大便可有黏液和血。還可有貧血、外周水腫、腹水、心包積液及肺水腫。另外男性可有陽(yáng)痿，育齡婦女可閉經(jīng)或流產(chǎn)。
3.腦膜腦炎期(睡眠期，晚期，Ⅱ期) 以中樞神經(jīng)系統癥狀為主者，即屬于晚期。此時(shí)患者體重明顯下降，不久即不能負擔正常工作，頭痛變?yōu)槌掷m性，反應遲鈍，出現嗜睡，并進(jìn)行性惡化，例外的是夜間失眠。臨床上引起腦膜腦炎。羅得西亞型見(jiàn)于病后2～6周，進(jìn)展迅速。岡比亞型見(jiàn)于病后數月至數年。錐蟲(chóng)首先侵犯腦干與間腦，繼而皮質(zhì)。癥狀為性格改變，對周?chē)挛锬魂P(guān)心，面無(wú)表情，行動(dòng)遲鈍，言語(yǔ)吞吐，遲鈍的感覺(jué)過(guò)敏(輕捏患者深部肌肉，需稍過(guò)一會(huì )兒才感疼痛，疼痛程度較正常重，即kerandel征)，唇舌顫動(dòng)，肌肉震顫，步態(tài)不穩，并有妄想、狂躁、明顯精神病表現，以及癲癇樣抽搐等。舞蹈病樣動(dòng)作與共濟失調多見(jiàn)于兒童，隨病情進(jìn)展出現肌強直、嗜睡，繼之昏睡，昏迷，并伴有全身瘙癢。此階段腦脊液檢查可見(jiàn)白細胞計數增加，通常>100×106/L，末期多死于高度營(yíng)養不良、肺部繼發(fā)感染、癲癇持續狀態(tài)或心力衰竭等。
凡從非洲流行區來(lái)的人發(fā)現錐蟲(chóng)性“下疳”、不規則發(fā)熱、劇烈頭痛、嗜睡、昏睡、淋巴結腫大、心動(dòng)過(guò)速者均有助于診斷。確診有賴(lài)于病原體的發(fā)現。

錐蟲(chóng)性“下疳”應與其他昆蟲(chóng)叮咬、蜂窩織炎或焦癡作鑒別。淋巴血液期應與瘧疾、傷寒、回歸熱、病毒性出血熱等發(fā)熱疾病相鑒別。晚期應與腦性瘧疾、病毒性腦炎、細菌性腦膜炎的急性期、結核性腦膜炎、神經(jīng)梅毒和腦脊液中以單核細胞增加為主的各種腦膜炎或腦膜腦炎相鑒別。應注意本病偶有梅毒血清試驗陽(yáng)性者。