查加斯病可按自然病史分為急性期、隱匿期和慢性期3個(gè)階段。
1.急性錐蟲(chóng)病 錐蟲(chóng)進(jìn)入人體以后，即開(kāi)始繁殖，并在體內廣泛播散，但感染者中只有不足10%可發(fā)生急性錐蟲(chóng)病，以幼童最常發(fā)生，且癥狀比成年人嚴重，主要表現為發(fā)熱、肌痛、出汗、肝脾腫大、心肌炎及其并發(fā)的心力衰竭，偶有腦膜腦炎等。大多數病人臨床癥狀可于數月后緩解，病死率約10%。
2.隱匿性錐蟲(chóng)病 隨后疾病進(jìn)入無(wú)癥狀的隱匿期，此期常可出現心電圖變化。目前認為心電圖異常是最終發(fā)生心肌病以及晚期病死率增高的重要標志。
3.慢性錐蟲(chóng)病 在錐蟲(chóng)感染后平均約20年左右，約30%感染者可出現慢性錐蟲(chóng)病的臨床表現，如心臟增大、心力衰竭、心律失常、血栓栓塞、不典型胸痛、右束支傳導阻滯及猝死等。本病的心肌炎為全心炎，亦可為節段性心肌損害和心室功能障礙，臨床上以室性心律失常、房室傳導阻滯、充血性心力衰竭以及血栓栓塞為其主要表現。
(1)心律失常：本病極易發(fā)生室性心律失常，并且是導致猝死最常見(jiàn)的原因。頻發(fā)室性期前收縮可為本病惟一的臨床表現，而伴有心臟其他病變者，則無(wú)一例外均有室性期前收縮。與其他心肌病相比，本病的室性期前收縮更為頻發(fā)，每天可達數萬(wàn)次，且在一段時(shí)間里持續頻發(fā)。有左心室室壁瘤或心功能障礙，或兩者兼有的病人，室性心律失常更為常見(jiàn)。室性心律失常出現的可能性及其嚴重程度與心肌病變的范圍和嚴重程度有關(guān)。持續性室性心動(dòng)過(guò)速亦不少見(jiàn)，且多伴有左前分支傳導阻滯或雙束支傳導阻滯，而不是單純的右束支傳導阻滯。心臟傳導系統受累的發(fā)生率可達80%，常表現為右束支傳導阻滯，或左前分支傳導阻滯，或兩者兼有，被認為是本病典型的心電圖表現。有研究發(fā)現，傳導阻滯似呈進(jìn)行性加重，從不完全性右束支傳導阻滯轉為完全性右束支傳導阻滯，由左前分支傳導阻滯，最后發(fā)展至完全性房室傳導阻滯，后者常見(jiàn)于晚期有心力衰竭的病人。心電圖上出現病理性Q波常提示預后不良;ST段抬高和T波異常通常提示存在室壁瘤。
(2)充血性心力衰竭：是廣泛而不可逆性心肌損傷和心臟結構異常的結果，大多發(fā)生于40歲以后，常晚于房室傳導阻滯或室壁瘤出現，為本病的晚期表現。
(3)自主神經(jīng)功能障礙：本病常在早期出現心血管自主神經(jīng)功能障礙，主要是由于副交感神經(jīng)的去神經(jīng)作用所致，表現為對運動(dòng)的血流動(dòng)力學(xué)反應遲鈍、直立性低血壓、心率變異性降低以及對壓力反射試驗、阿托品試驗異常。有研究發(fā)現，血漿去甲腎上腺素水平與自主神經(jīng)功能異常的嚴重程度有相關(guān)性;也有學(xué)者指出，本病的心臟性猝死亦可能與其自主神經(jīng)功能障礙有關(guān)。
心臟的克魯斯錐蟲(chóng)感染可由心臟組織的病理學(xué)檢查或動(dòng)物接種來(lái)證實(shí)，但病理學(xué)診斷陽(yáng)性率很低，動(dòng)物接種不能廣泛應用，且對于晚期病人亦不敏感，故通常還是根據流行病學(xué)資料、血清學(xué)檢查以及臨床表現綜合考慮做出診斷，主要標準如下(在非流行地區，應更加嚴格執行該標準)：
1.曾在Chagas病流行地區居住過(guò)。
2.克魯斯錐蟲(chóng)的血清學(xué)試驗陽(yáng)性。
3.心臟臨床表現符合Chagas心臟病。
4.各種心臟表現雖可歸因于其他心臟病，但并無(wú)這些心臟病的證據。

應與冠心病、特發(fā)性擴張型心肌病、酒精性心肌病等鑒別。
1.冠心病 本病與錐蟲(chóng)性心肌炎一樣可累及心肌，造成心臟擴大，均可有心律不齊、心力衰竭等。冠心病多見(jiàn)于45歲以上的男人和絕經(jīng)期后的女性，年齡大者更多見(jiàn)。冠心病往往有多種患病因素，如高脂血癥、高血壓、糖尿病、肥胖少動(dòng)、家族史等。而錐蟲(chóng)性心肌病多有曾在克魯斯錐蟲(chóng)流行地區居住過(guò)史，克魯斯錐蟲(chóng)的血清學(xué)實(shí)驗陽(yáng)性，往往有Chagas心臟病的臨床表現等可與該病進(jìn)行鑒別。
2.擴張型心肌病 可有家族史，病程長(cháng)，進(jìn)展緩慢，擴張型心肌病心臟常明顯擴大，可有動(dòng)脈栓塞現象，病毒分離陰性，血清病毒中和抗體效價(jià)無(wú)短期內增高，心電圖常有各種心律失常，有時(shí)可見(jiàn)病理性Q波。晚期可出現心臟擴大和心力衰竭的癥狀。錐蟲(chóng)性心肌炎有曾在克魯斯錐蟲(chóng)流行地區居住過(guò)史，克魯斯錐蟲(chóng)的血清學(xué)實(shí)驗陽(yáng)性和典型的臨床癥狀和體征。
3.酒精性心肌病 該病患者有大量飲酒、長(cháng)期飲酒史(多持續10年以上，每天純乙醇量125ml);出現心臟擴大、心律失常、胸痛、血壓偏高等改變，晚期可出現充血性心力衰竭。雖與本病的部分癥狀、體征相近似，但要從流行病史、克魯斯錐蟲(chóng)的血清學(xué)實(shí)驗陽(yáng)性及常并發(fā)多器官擴張等表現進(jìn)行鑒別。