鉤體病的潛伏期為1～2周，最長(cháng)可達4周。早期可出現發(fā)熱、肌痛(尤其是腓腸肌疼痛和壓痛)、全身乏力、眼結膜充血及淋巴結腫大，具有特征性的“三癥狀”、“三體征”的感染中毒表現。患者常于病程3～10天出現器官損害癥狀，按不同的臨床表現可分為流感傷寒型、肺出血型、黃疸出血型、腎功能衰竭型及腦膜腦炎型等。其中肺出血型又可分為普通肺出血型 和肺彌漫性出血型，后者病情兇險，病死率高。
鉤體病相關(guān)腎病可伴隨流感傷寒型、黃疸出血型鉤體病發(fā)生，若單獨出現，即為腎功能衰竭型。臨床表現主要以少尿、蛋白尿、尿中有少量白細胞、紅細胞、管型等。少數嚴重患者病情呈進(jìn)行性加重，出現無(wú)尿、酸中毒、腎功能衰竭、尿毒癥。鉤體病相關(guān)腎病一般預后較好，多數病人通過(guò)少尿期、多尿期而恢復。
近年來(lái)有人將鉤體病的表現，分為兩相病程，
1.“鉤體血癥”相 高熱、結膜充血、肌痛和頭痛，然后可出現肝炎、腎炎及出血。
2.“免疫”相 初期發(fā)熱等癥狀逐漸消失，中樞與外周神經(jīng)系統的癥狀出現。
在“三癥狀”、“三體征”出現的第3天后，患者可發(fā)生嚴重的黃疸、腎衰，此時(shí)應懷疑本病。確診主要依靠特異性診斷試驗。
如在流行區，流行季節有疫水接觸史等流行病學(xué)資料。患者臨床表現為早期出現“三癥狀”“三體征”(發(fā)熱、肌痛、全身乏力以及眼結膜充血、腓腸肌壓痛、淋巴結腫大觸痛)的較突出癥狀。中期出現多器官損害，主要是黃疸、出血和ARF等。實(shí)驗室檢查見(jiàn)白細胞增高、尿異常及腎功能損害。特異性診斷試驗陽(yáng)性既可確診本病。

需與以下疾病相鑒別：
1.重型病毒性肝炎 重型肝炎可有深度黃疸、出血傾向、腎功能損害(肝腎綜合征)，易與鉤體病混淆。除流行病學(xué)的特點(diǎn)外，主要的鑒別要點(diǎn)是：
(1)起病形式不同。重肝的感染中毒癥狀輕而消化系統癥狀顯著(zhù)，罕有結膜充血。淋巴結腫大，無(wú)腓腸肌壓痛。
(2)重肝的病程進(jìn)展相對較緩慢。
(3)與鉤體患者相比，重肝患者ARF出現較晚，罕見(jiàn)在1周內發(fā)生。腎功衰竭往往是重肝患者的臨終階段。
(4)重肝的肝功能損害程度與黃疸程度成正比，也較鉤體為重。
(5)肝炎病毒標記物檢查和鉤體病的特異性診斷試驗，對兩者的鑒別具有決定性的意義。
2.流行性出血熱 有畏寒、發(fā)熱、出血與腎損害，其中約20%的患者有腓腸肌痛和壓痛，酷似鉤體病。但流行性出血熱常有較突出的頭、眼眶及腰疼痛，顏面、頸，胸部充血，眼結膜和口腔黏膜充血、水腫，皮膚黏膜瘀點(diǎn)，胸、腋下瘀點(diǎn)呈搔抓樣。退熱后癥狀加重。黃疸少見(jiàn)，尿中常有膜狀物，血清學(xué)檢查可測得相應的特異性抗體。
3.急性腎小球腎炎 臨床上有水腫、血尿、蛋白尿，尿中有紅、白細胞和管型。常可發(fā)生腎功能損害，嚴重者出現氮質(zhì)血癥。但無(wú)明顯發(fā)熱，也無(wú)鉤體病的早期感染中毒癥狀以及相應的其他臨床特征，如出血、黃疸等。
4.急性腎盂腎炎、敗血癥、急性溶血性貧血等，均可表現為發(fā)熱和腎損害，應與鉤體病性腎衰相鑒別。