腎活檢及對染色組織光鏡檢查為診斷免疫介導性腎臟病，估計其預后及選擇治療提供了最好的方法。鑒于不同的免疫機制可引起相似的形態(tài)學(xué)變化，故使用熒光素標記的特異抗體的免疫熒光顯微鏡檢查常也有助于甄別腎臟中免疫成分的類(lèi)型及定位。
補體沉積的類(lèi)型和形式有助于診斷。補體的沉積通常隨免疫復合物或免疫球蛋白，或兩者皆有的沉積形式。但無(wú)免疫球蛋白，C1q或C4沉積的情況下，C3的沉積可發(fā)生在經(jīng)替代途徑激活的Ⅱ型膜增生型腎小球腎炎。
電子顯微鏡檢查可見(jiàn)腎小球和腎小管結構增厚及其成分的亞顯微變化，并能闡明免疫沉積的存在與定位。
尿液分析常常有助于檢查尿中蛋白及有形成分。實(shí)際上腎病綜合征（參見(jiàn)第224節）見(jiàn)于各種類(lèi)型的免疫介導性腎臟疾病中。尿中常可見(jiàn)大量的蛋白和富含脂肪的小管上皮細胞（偏振光顯微鏡橢圓脂肪體呈"馬耳他十字"）。雖然腎病綜合征可發(fā)生于非免疫性腎臟病（如糖尿病）中，但腎病范圍的蛋白尿常提示了有潛在的免疫機制。
引起壞死的損傷，如抗腎小球基底膜病中急性細胞毒型損傷，可引起明顯的血尿。免疫復合物型的損害（如鏈球菌感染后腎小球腎炎）與血尿及紅細胞管型有關(guān)。血尿，白細胞尿，紅細胞管型及上皮細胞管型與活動(dòng)性SLE及其他一些膠原-血管性疾病有關(guān)。膜增生型腎小球腎炎與膜型腎小球腎炎伴有明顯的蛋白尿。膜增生型腎小球腎炎常發(fā)生血尿，但膜型腎小球腎炎罕見(jiàn)血尿。微小病變型及局灶硬化型腎小球腎炎可僅有蛋白尿。
血清學(xué)檢查在細胞毒抗體介導腎臟疾病（如抗基底膜抗體，抗HLA抗體）循環(huán)中可查到細胞毒抗體。如用C1q結合及Raji細胞測定，可在各種免疫復合物介導腎臟疾病中發(fā)現循環(huán)免疫復合物。在A(yíng)NCA介導腎臟病（如Wegener肉芽腫）循環(huán)中可查到ANCA。
補體蛋白水平的不同常可用于鑒別免疫介導性腎臟病的類(lèi)型。當以激活替代途徑為主時(shí)（如膜增生型腎小球腎炎及多數鏈球菌感染后腎小球腎炎），補體消耗時(shí)由活化C3啟動(dòng)的，故補逶縉誄煞？C1q，C4和C2）未減少。如通過(guò)經(jīng)典途徑激活（如SLE），消耗從早期成分開(kāi)始，故早期成分減少。只要C3腎炎因子存在，C3減少，而C1q，C4和C2正常，則可診斷為經(jīng)替代途徑激活的膜增生型腎小球腎炎。
其他有用的血清學(xué)檢查包括在鏈球菌感染后腎小球腎炎中針對鏈球菌抗原的抗體滴度上升。其他感染后腎小球腎炎也可根據血清學(xué)檢查診斷，如一種梅毒陽(yáng)性試驗，肝炎相關(guān)性抗原，或對另一些感染微生物抗體滴度升高。AIDS可運用聚合酶技術(shù)發(fā)現HIV抗體或HIV抗原來(lái)診斷。
組織相容性試驗可幫助診斷某些類(lèi)型的免疫介導性腎病。例如鏈球菌感染后腎小球腎炎與HLA-B12相關(guān)，IgA腎病與HLA-B35，HLA-DR4相關(guān)以及抗基底膜或Goodpasture綜合征與HLA-DR2相關(guān)。

主要與繼發(fā)性腎臟病相鑒別，包括糖尿病性腎病、尿酸腎病、淀粉樣變腎病和脂蛋白腎小球病。