1.克羅恩(Crohn)病　本病的臨床表現和X線(xiàn)鋇餐表現有時(shí)可與腸結核相似，容易造成誤診，但兩者仍有一些不同之處以資鑒別：

　　(1)腸結核多伴隨其他器官結核。

　　(2)腸結核并發(fā)腸瘺、出血、腸壁或器官膿腫的機會(huì )比Crohn病少。

　　(3)X線(xiàn)檢查結核造成腸道的縮短比Crohn病更明顯，病變單純累及回腸多見(jiàn)于Crohn病，而僅累及盲腸則多考慮為結核。

　　(4)內鏡檢查腸結核的潰瘍常呈環(huán)形，而Crohn病的潰瘍多為縱行，裂隙狀潰瘍及鋪路石征多見(jiàn)于Crohn病。

　　(5)組織學(xué)(最重要的鑒別)腸結核可在腸壁或腸系膜淋巴結找到干酪壞死灶或結核桿菌而Crohn病則否。

　　(6)抗結核治療腸結核有效，但Crohn病效果差。

　　(7)腸結核手術(shù)切除病變后的復發(fā)率比Crohn病低，Crohn病術(shù)后復發(fā)率在5年內一般達50%。

　　2.結腸癌　本病因有腹痛、腹瀉、腹塊及進(jìn)行性消瘦、蒼白等表現，必須和腸結核加以鑒別。鑒別要點(diǎn)可包括以下幾方面：

　　(1)發(fā)病年齡一般比腸結核大，常在40歲以上，且無(wú)腸外結核病變證據。

　　(2)病程有進(jìn)行性發(fā)展趨勢，一般無(wú)發(fā)熱，盜汗等毒血癥表現，而消瘦蒼白等全身消耗癥狀比較明顯。

　　(3)腹塊開(kāi)始出現時(shí)往往可以推動(dòng)，其粘連固定不如腸結核顯著(zhù)，壓痛常缺如，但表面呈結節感，質(zhì)地較堅硬。

　　(4)X線(xiàn)檢查的主要發(fā)現是病變部位有鋇劑充盈缺損，但涉及范圍較局限，不累及回腸。

　　(5)腸梗阻更為常見(jiàn)，且出現較早。

　　(6)纖維結腸鏡檢查可窺見(jiàn)腫瘤，在直視下取活檢及細胞刷涂片均可證實(shí)結腸癌診斷。

　　3.腸淋巴瘤　腸淋巴瘤為一般狀況，惡化比腸結核迅速，腹塊出現較早，X線(xiàn)顯示擴張腸段黏膜皺襞有破壞，可伴有淺表淋巴結及肝脾腫大，肺門(mén)淋巴結腫大，抗結核治療無(wú)效。如果病變在回盲部，結腸鏡檢查并活檢往往會(huì )有陽(yáng)性結果，倘若臨床鑒別十分困難，應及早手術(shù)探查。

　　4.阿米巴或血吸蟲(chóng)肉芽腫　腸阿米巴病或血吸蟲(chóng)病在其慢性期可以形成肉芽腫病變，特別是病變涉及回盲部者，常與腸結核的表現相似，應加鑒別。但是這些患者經(jīng)追詢(xún)病史均有流行病學(xué)和感染史，其膿血便均較腸結核為明顯，大便檢驗可以查到阿米巴滋養體，包囊或血吸蟲(chóng)卵，必要時(shí)進(jìn)行糞便孵化找血吸蟲(chóng)毛蚴，通過(guò)纖維結腸鏡檢查可窺見(jiàn)相應的病變，特異性治療能夠獲得療效。

　　5.潰瘍性結腸炎并發(fā)逆行性回腸炎　兩者鑒別一般并無(wú)困難。本病的臨床表現以膿血便為主，這在腸結核極為少見(jiàn)。潰瘍性結腸炎如涉及回腸者，其病變必累及整個(gè)結腸，并且以乙狀結腸，直腸最為嚴重，做直腸或乙狀結腸鏡與活組織檢查可不難作出診斷。

　　6.耶爾森菌腸炎　耶爾森菌最常侵犯末端回腸，使腸壁增厚，腸黏膜炎癥改變，腸系膜淋巴結腫大，其表現與回腸結核相似。但耶爾森菌腸炎病程短暫，能自愈，與腸結核可以區分，如果在急性期取糞便、血液或組織標本培養，該菌可能陽(yáng)性。血清凝集試驗測定抗體滴度升高對診斷該病亦有幫助。

　　7.其他　一些少見(jiàn)的疾病例如腸道非典型分枝桿菌病(多見(jiàn)于A(yíng)IDS患者)，性病性淋巴肉芽腫，梅毒侵犯腸道，腸放線(xiàn)菌病消化性潰瘍與膽道感染等。根據病史、體征和有關(guān)實(shí)驗室檢查及其他相應的輔助檢查等可與腸結核相鑒別。