1、遺傳因素：遺傳學(xué)研究證明，本病為多基因遺傳性疾病，20-30%的患者具有陽(yáng)性的遺傳因素。經(jīng)常可見(jiàn)在患者的親屬中有類(lèi)似的畸形發(fā)生。

　　2、環(huán)境因素：如懷孕期間維生素的缺乏，母親在懷孕期間感染病毒，接觸X射線(xiàn)、激素或抗腫瘤藥物、抗組胺藥、煙酒刺激等，都可能造成遺傳基因的突變等一系列畸變。

　　3、營(yíng)養因素：婦女懷孕期間的嘔吐和偏食可影響營(yíng)養攝入，造成維生素缺乏，在動(dòng)物實(shí)驗中，用缺乏維生素A、E的食物喂養懷孕小白鼠時(shí)，出生的幼鼠常有唇腭裂發(fā)生。

　　4、病毒感染：在妊娠早期，如遇風(fēng)疹病毒感染，可能成為嬰兒唇腭裂的原因。

　　5、藥物因素：有些藥物能通過(guò)胎盤(pán)屏障影響胚胎發(fā)育，如安眠藥、抗過(guò)敏藥、苯妥英那、腎上腺皮質(zhì)激素、環(huán)磷酸胺均可導致胎兒畸形。

　　6、內分泌影響：在懷孕早期，如孕婦因精神緊張及外傷等原因，可使體內的腎上腺皮質(zhì)激素分泌增加，從而導致嬰兒先天畸形。