NGU好發(fā)于青年性旺盛時(shí)期。潛伏期可由數天至數個(gè)月，但多數為1～3周。
1.男性NGU 癥狀與淋菌性尿道炎相似，但程度較輕，可有尿道刺癢，燒灼感和排尿疼痛，少數有尿頻。尿道口輕度紅腫，分泌物稀薄、量少，為漿液性或膿性，多需用手擠壓尿道才見(jiàn)分泌物溢出。長(cháng)時(shí)間不排尿或晨起首次排尿前有時(shí)能見(jiàn)到逸出尿道口的分泌物污染內褲，結成黏糊狀可封住尿道口(稱(chēng)為糊口)。有些病人(30%～40%)可無(wú)任何癥狀，也有不少病人癥狀不典型，因此，約有一半的病人在初診時(shí)易被誤診或漏診。有19%～45%患者同時(shí)伴有淋球菌感染。 50%～70%的男性患者如不治療可在1～3個(gè)月內自愈。未經(jīng)治療的衣原體尿道炎癥狀可自行減輕，病情緩解，但無(wú)癥狀的衣原體感染也可持續數個(gè)月至數年。
2.女性NGU 女性NGU或NSGI的臨床特點(diǎn)是癥狀不明顯或無(wú)癥狀。當引起尿道炎時(shí)，約有50%的病人有尿頻和排尿困難，但無(wú)尿痛癥狀或僅有很輕微的尿痛，可有少量的尿道分泌物。若感染主要在宮頸時(shí)，則表現為宮頸黏液膿性分泌物(37%婦女)和肥大性異位(19%)。肥大性異位(hypertrophicectopy)是指水腫、充血和易致出血的異位區。可有陰道及外陰瘙癢，下腹部不適等癥狀，常被誤診為一般的婦科病。未治療的宮頸衣原體感染可持續1年或更長(cháng)時(shí)間，且會(huì )出現各種臨床表現和并發(fā)癥，如尿道炎、急性尿道炎綜合征、子宮內膜炎、成人沙眼衣原體眼部感染等。以宮頸為中心的沙眼衣原體播散的危險性可能小于生殖系統淋病播散的危險性。
3.合并癥 附睪炎是男性NGU的主要并發(fā)癥，它的主要癥狀是附睪腫大、發(fā)硬且有觸痛，如累及睪丸時(shí)可出現疼痛、觸痛，陰囊水腫和輸精管變粗等。從腫脹的附睪中抽取液體，有時(shí)可分離到衣原體。臨床上常可見(jiàn)到附睪炎和尿道炎同時(shí)存在。并發(fā)前列腺炎時(shí)可有后尿道、會(huì )陰和肛門(mén)部位的重墜和鈍痛感。疼痛可放射到橫隔以下各個(gè)部位，在晨間較為明顯。可產(chǎn)生性功能障礙。直腸指檢可觸及腫大的和有壓痛的前列腺。在急性期時(shí)，由于前列腺?lài)乐爻溲[大的腺體可造成尿道的梗阻癥狀如尿流變細、排尿無(wú)力、尿頻和尿流中斷等癥狀。在男性，系統性并發(fā)癥及生殖器外器官的感染比較少見(jiàn)，常見(jiàn)的有急性濾泡性眼結膜炎、Reiter綜合征(即尿道炎、多發(fā)性關(guān)節炎、結膜炎三聯(lián)征)、眼色素膜炎和強直性脊柱炎等。有報告解脲支原體可吸附在精子上，抑制受精，造成生育力低下。
在女性，主要并發(fā)癥為急性輸卵管炎。急性期可有寒戰、高熱和下腹痛，可有骶部酸痛，并向大腿部放射。婦科檢查宮頸可有推舉痛，子宮一側可有明顯壓痛和反跳痛，約25%患者可捫及增粗的輸卵管和附件的炎性腫塊。慢性輸卵管炎表現為下腹部隱痛、腰痛、月經(jīng)異常及不孕癥等。此外，衣原體感染還可導致異位妊娠、不育、流產(chǎn)、宮內死胎及新生兒死亡。但亦有許多患者除不孕外，可無(wú)任何自覺(jué)癥狀。
1.病史 有婚外性接觸史或配偶感染史，通常潛伏期1～3周。
2.有NGU的癥狀和體征。
3.實(shí)驗室檢查
(1)尿道或宮頸分泌物涂片未見(jiàn)細胞內(外)革蘭染色陰性雙球菌，培養亦無(wú)淋球菌生長(cháng)。
(2)男性尿道分泌物涂片可見(jiàn)到多形核白細胞，在油鏡(1000倍)視野下平均每視野中多形核白細胞>4個(gè)為陽(yáng)性。晨尿(前段尿15m1)沉淀在高倍鏡(400倍)視野下每視野平均有多于15個(gè)多形核白細胞有診斷意義。或男性病人<60歲，無(wú)腎臟疾病或膀胱感染、無(wú)前列腺炎或尿路機械損傷，但尿白細胞酯酶試驗陽(yáng)性。
(3)女性宮頸黏液膿性分泌物在油鏡(1000倍)視野下平均每視野中多形核白細胞>10個(gè)為陽(yáng)性(但應除外滴蟲(chóng)感染)。
(4)衣原體或支原體檢查陽(yáng)性。

尿道炎首先應與淋病性尿道炎區別，淋病性尿道炎是一種特異性感染的性病，尿道有膿性分泌物，膿液涂片染色檢查可見(jiàn)在分葉核粒細胞內有革蘭氏陰性雙球菌。其次，應與非淋菌性尿道炎及滴蟲(chóng)性尿道炎區別，女性容易在陰道內找到滴蟲(chóng)，而在男性不易找到滴蟲(chóng)，常需在包皮下、尿道口分泌物、前列腺液以及尿液中檢查有無(wú)滴蟲(chóng)，作出診斷。Reiter癥候群除尿道炎外，同時(shí)有結膜炎和關(guān)節炎。
臨床上，沙眼衣原體感染常與淋球菌感染有緊密聯(lián)系。這兩種病原體均可引起男性尿道炎、附睪炎、直腸炎，女性宮頸炎、尿道炎、盆腔炎等，它們引起的疾病，其臨床癥狀和體征差別不大，因此單憑臨床觀(guān)察是不易區分的。而且沙眼衣原體和淋球菌可合并感染。準確的鑒別診斷有賴(lài)于實(shí)驗室檢查。在臨床實(shí)踐中，常對確定為淋球菌感染者，無(wú)論是否檢查沙眼衣原體感染，均常規給予抗淋球菌和沙眼衣原體兩種病原體的治療。