小腸中有少數(shù)蛔蟲感染時可無癥狀，稱蛔蟲感染者，大量感染而引起疾病稱蛔蟲病。
腸道蛔蟲常引起反復發(fā)作的上腹部或臍周腹痛。由于蟲體的機械性刺激及其分泌的毒物和代謝產物可引起消化道功能紊亂和異性蛋白反應，如納差、惡心、嘔吐、腹瀉和蕁麻疹。兒童嚴重感染者，可引起營養(yǎng)不良，精神不安，失眠、磨牙、夜驚等。
腸內蛔蟲一般處于安靜狀態(tài)，但受到各種刺激（如高熱、消化不良、驅蟲不當?shù)龋┖笠资够紫x騷動及鉆孔，可引起嚴重的并發(fā)癥，常見的有：
一、膽道蛔蟲癥　系蛔蟲鉆入膽道而引起，表現(xiàn)為劍突下突然發(fā)生陣發(fā)性絞痛或鉆頂痛，可放射至背部及右肩部，難于忍受，極度不安。常伴有惡心及嘔吐。腹壁軟僅疼痛發(fā)作時腹壁輕度痙攣，劍突下明顯的局限性壓痛。當進入膽道的蛔蟲退到小腸后，則癥狀突然消失。若蛔蟲進入膽囊管或肝內膽管時，可繼發(fā)細菌感染而引起急性化膿性膽囊炎、膽管炎或急性出血壞死型胰腺炎；深入肝內膽小管時可產生細菌性肝膿腫。當蛔蟲殘體或蛔蟲卵長期存留膽管或膽囊時，可以其為核心，逐漸形成膽石。
二、蛔蟲性腸梗阻　多見于小兒。由于蟲數(shù)較多，扭結成團阻塞腸腔，引起部分腸梗阻。病人有陣發(fā)性腹痛、惡心、嘔吐、腹壁軟，可捫及大小不等粗麻繩樣索狀塊物。如不及時治療，可發(fā)展為完全性腸梗阻。
三、其它 傷寒或少數(shù)胃、十二指腸潰瘍病患者感染蛔蟲后，蛔蟲可穿破病變處腸胃壁引起穿孔，產生彌漫性腹膜炎?；紫x向上逆行時可由鼻孔、口腔排出，或鉆入耳咽管而引起耳鼓膜穿孔，并由外耳道排蟲。偶而蛔蟲可到達喉或氣管，引起窒息。

應與其他寄生蟲引起的腸道疾病相鑒別如：阿米巴腸炎，藍氏賈第鞭毛蟲。