臨床癥狀主要包括上腹痛、腹脹、早飽、噯氣、厭食、燒心、反酸、惡心和嘔吐。病程多在2年內，癥狀可反復發(fā)作，也可在相當一段時(shí)間內無(wú)癥狀。可以某一癥狀為主，也可有多個(gè)癥狀的疊加。多數難以明確引起或加重病情的誘因。
1989年，美國芝加哥專(zhuān)題會(huì )議將功能性消化不良分為5個(gè)亞型：①反流樣消化不良(reflux-like dyspcpsia);②運動(dòng)障礙樣消化不良(dysmotility-like dyspepsia);③潰瘍樣消化不良(ulcer-like dyspepsia);④吞氣癥(aerophagia); ⑤特發(fā)性消化不良(idiopathic dyspepsia)。但后面的兩型概念比較模糊，有的學(xué)者提出分成3型(即前3型)。但目前采用較多的是4型分類(lèi)：①運動(dòng)障礙樣型;②反流樣型;③潰瘍樣型;④非特異型。
1.運動(dòng)障礙樣消化不良 此型患者的表現以腹脹、早飽、噯氣為主。癥狀多在進(jìn)食后加重。過(guò)飽時(shí)會(huì )出現腹痛、惡心，甚至嘔吐。動(dòng)力學(xué)檢查約50%～60%患者存在胃近端和遠端收縮和舒張障礙。
2.反流樣消化不良 突出的表現是胸骨后痛，燒心，反流。內鏡檢查未發(fā)現食管炎，但24h pH監測可發(fā)現部分患者有胃食管酸反流。對于無(wú)酸反流者出現此類(lèi)癥狀，認為與食管對酸敏感性增加有關(guān)。
3.潰瘍樣消化不良 主要表現與十二指腸潰瘍特點(diǎn)相同，夜間痛，饑餓痛，進(jìn)食或服抗酸藥能緩解，可伴有反酸，少數患者伴燒心，癥狀呈慢性周期性。內鏡檢查未發(fā)現潰瘍和糜爛性炎癥。
4.非特異型消化不良 消化不良表現不能歸入上述類(lèi)型者，常合并腸易激綜合征。
但是，除了反流樣消化不良，其他幾種分類(lèi)并無(wú)重要的臨床意義。許多病人并不止歸入一個(gè)亞型;而且這種分類(lèi)與病理生理學(xué)紊亂和臨床療效無(wú)關(guān)。例如：動(dòng)力障礙亞型的消化不良病人，胃輕癱的發(fā)生率并不比其他亞型高;促動(dòng)力藥對他們的療效也并不一定好于其他亞型病人。然而，反流亞型的消化不良病人胃食管反流的發(fā)生率，確實(shí)要高于其他亞型病人，且抗反流治療效果更好。
1.診斷 對于功能性消化不良的診斷，首先應排除器質(zhì)性消化不良。除了仔細詢(xún)問(wèn)病史及全面體檢外，應進(jìn)行相應的輔助檢查及實(shí)驗室檢查。多數根據第一線(xiàn)檢查即可基本確定功能性消化不良的診斷。此外，許多原因不明的腹痛、惡心、嘔吐患者往往經(jīng)胃腸道壓力檢查找到了病因，這些檢查也逐漸開(kāi)始應用于兒科病人。
2.功能性消化不良通用的診斷標準
(1)臨床表現：慢性上腹痛、腹脹、早飽、噯氣、反酸、燒心、惡心、嘔吐、喂養困難等上消化道癥狀，持續至少4周。
(2)輔助檢查：內鏡檢查未發(fā)現胃、十二指腸潰瘍、糜爛、腫瘤等器質(zhì)性病變，未發(fā)現食管炎，也無(wú)上述疾病史。B超、X線(xiàn)檢查，排除肝、膽、胰疾病。
(3)實(shí)驗室檢查，排除肝、膽、胰疾病。
(4)無(wú)糖尿病史，結締組織病，腎臟疾病及精神病。
(5)無(wú)腹部手術(shù)史。
3.羅馬Ⅱ診斷標準 羅馬Ⅱ對小兒功能性消化不良的診斷采用了成人的標準，具體如下：
下列癥狀在12個(gè)月內至少出現12周，但無(wú)須連續：
(1)上腹部持續性或復發(fā)性疼痛或不適感。
(2)無(wú)器質(zhì)性疾病的證據。
(3)排便后不緩解，大便的次數及形狀無(wú)改變。

1.胃食管反流 胃食管反流性疾病功能性消化不良中的反流亞型與其鑒別困難，胃食管反流性疾病具有典型或不典型反流癥狀，內鏡證實(shí)有不同程度的食管炎癥改變，24h食管pH監測有酸反應，無(wú)內鏡下食管炎表現的患者屬于反流樣消化不良或胃食管反流性疾病不易確定，但兩者在治療上是相同的。 2.消化性潰瘍 具有潰瘍樣癥狀的器質(zhì)性消化不良包括：十二指腸潰瘍，十二指腸炎，幽門(mén)管潰瘍，幽門(mén)前區潰瘍，糜爛性胃竇炎。在診斷功能性消化不良潰瘍亞型前必須進(jìn)行內鏡檢查以排除以上器質(zhì)性病變。 　　3.胃輕癱 許多全身性的或消化道疾病均可引起胃排空功能的障礙，造成胃輕癱。較常見(jiàn)的原因有糖尿病、尿毒癥、結締組織病。在診斷功能性消化不良運動(dòng)障礙亞型時(shí)，應仔細排除其他原因所致的胃輕癱。 　4.慢性難治性腹痛(CIPA) CIPA病人70%為女性，多有身體或心理創(chuàng )傷史。病人常常主訴有長(cháng)期腹痛(超過(guò)6個(gè)月)，且腹痛彌漫，多伴有腹部以外的癥狀。大多數病人經(jīng)過(guò)廣泛的檢查而結果均為陰性。這類(lèi)病人多數有嚴重的潛在的心理疾患，包括抑郁、焦慮和軀體形態(tài)的紊亂。他們常堅持自己有嚴重的疾病并要求進(jìn)一步檢查。對這類(lèi)病人應提供多種方式的心理、行為和藥物聯(lián)合治療。