1.潛伏期 自數小時(shí)至8天不等，大多數為1～3天。
2.細菌性痢疾的臨床分型 根據病程及病情，可分為急性菌痢、慢性菌痢及中毒型痢疾。因中毒型痢疾病情特殊隨后有敘述，在此先討論急性菌痢、慢性菌痢的一般經(jīng)過(guò)。
(1)急性細菌性痢疾：
①典型痢疾：典型病例起病急，發(fā)熱，體溫為低熱或高熱，腹瀉、大便每天10～30次，糞便帶黏液及膿血。有惡心，嘔吐，陣發(fā)性腹痛。腹部有輕壓痛。有時(shí)左下腹可觸及痙攣的乙狀結腸腸管。腸鳴音亢進(jìn)。便后有里急后重下墜感。患兒全身乏力，食欲減退。嬰幼兒有時(shí)可有高熱驚厥。多數急性痢疾患兒經(jīng)合理治療，可于數天內逐漸減輕而痊愈，預后良好。年長(cháng)兒童大便很快成形，嬰幼兒可持續數天稀便，這與嬰幼兒腸道功能恢復較慢有關(guān)。
②非典型痢疾：不發(fā)熱或只有微熱，也無(wú)中毒癥狀，輕度腹瀉，稀便、糞便內只有黏液而無(wú)膿血。只有糞便培養陽(yáng)性才能確診。在流行時(shí)，這類(lèi)病例數可能超過(guò)典型病例數。因其經(jīng)過(guò)類(lèi)似一般腸炎，易被忽視，常成為痢疾的傳播者。
(2)慢性細菌性痢疾：病程超過(guò)2周稱(chēng)遷延性痢疾，超過(guò)2個(gè)月則稱(chēng)慢性痢疾。其發(fā)生原因，主要是因體質(zhì)瘦弱、有營(yíng)養不良、佝僂病或貧血等合并癥。或因這類(lèi)病兒未得到合理治療所造成。因病程日久，漸消瘦，糞便含大量黏液、不一定帶膿血，或黏液便與膿血便交替出現。糞便仍可培養出痢疾桿菌，但陽(yáng)性率顯著(zhù)低于急性痢疾。慢性痢疾患兒如合并嚴重營(yíng)養不良，往往容易發(fā)生一些危象。病兒可因發(fā)生電解質(zhì)紊亂(低鈉、低鉀、低鈣)，嚴重心肌損害而意外死亡。這類(lèi)病兒在我國已很少見(jiàn)到，而在其他發(fā)展中國家經(jīng)常見(jiàn)到。在慢性痢疾過(guò)程中有時(shí)癥狀突然加重，呈急性發(fā)作的表現。
普通型菌痢見(jiàn)到膿血便，診斷并不困難。應注意下列幾點(diǎn)有助于確診：
1.夏秋季節 夏秋季節腹瀉伴有發(fā)熱、糞便帶黏液膿血者。
2.接觸史 家中或同居室最近有了痢疾患者，應予警惕。
3.大便鏡檢 北京市標準：每一高倍鏡視野膿細胞>15個(gè)并見(jiàn)有紅細胞，門(mén)診即可診斷菌痢并填報傳染病卡片。
4.糞便培養 嚴格說(shuō)來(lái)準確診斷要靠糞便培養。作培養時(shí)要采取新鮮膿血便，最好在床邊即接種培養，若不能即時(shí)做，可將標本放入緩沖甘油鹽水液中保存，盡快送細菌室培養。在用抗菌藥治療前采集糞便標本，可提高培養陽(yáng)性率。
5.PCR快速診斷 最近已研制出PCR快速診斷法，但需集中多份標本一起檢查，尚不能廣泛用于臨床。

細菌性痢疾以膿血便為其特征。但是僅憑膿血便診斷菌痢，誤診率可達30%左右。最容易與以下腸炎相混淆：
1.侵襲性大腸埃希桿菌(EIEC)腸炎 本病發(fā)病季節與病癥極似菌痢，也表現為發(fā)熱、腹瀉、膿血便，也發(fā)現有類(lèi)似中毒型痢疾的表現。鑒別需依據糞便培養，培養結果：痢疾桿菌陰性，發(fā)現有大腸埃希桿菌，再用此大腸埃希桿菌菌液滴入豚鼠眼結膜囊內24h后如發(fā)現豚鼠結膜充血有炎癥反應，即可確診為侵襲性大腸埃希桿菌。
2.空腸彎曲菌腸炎 本病發(fā)病季節與臨床經(jīng)過(guò)也類(lèi)似菌痢。多見(jiàn)于3歲以上小兒。癥狀表現發(fā)熱、腹瀉，先為稀便，以后可表現為膿血便，類(lèi)似痢疾。鑒別需依據糞便培養。采用微需氧43℃培養法，可培養出空腸彎曲菌。
3.沙門(mén)菌腸炎 以小嬰兒多見(jiàn)，糞便多樣化為其特點(diǎn)，開(kāi)始為稀便，以后可表現為黏液、膿血便。易誤診為菌痢。鑒別首先發(fā)病年齡不同，痢疾多見(jiàn)于3歲以上兒童，小嬰少見(jiàn)。準確鑒別需依據糞便培養。