PKU是一種遺傳性疾病，故新生兒即有高苯丙氨酸血癥，因未進(jìn)食，血苯丙氨酸及其有害的代謝產(chǎn)物濃度不高，故出生時(shí)無(wú)臨床表現。如果對新生兒未作苯丙酮尿癥篩選，隨著(zhù)喂食的時(shí)間延長(cháng)，血中苯丙氨酸及其代謝產(chǎn)物逐漸升高，臨床癥狀才漸漸表現出來(lái)。主要臨床表現有：
1.生長(cháng)發(fā)育遲緩 除軀體生長(cháng)發(fā)育遲緩外，主要表現在智力發(fā)育遲緩。表現在智商低于同齡正常嬰兒,生后4～9個(gè)月即可出現。重型者智商低于50，約14%以上兒童達白癡水平，語(yǔ)言發(fā)育障礙尤為明顯。這些表現提示大腦發(fā)育障礙。限制新生兒攝入苯丙氨酸可防止智力發(fā)育障礙，重型PKU患兒智力發(fā)育障礙比輕型者血中苯丙氨酸濃度高，據此可以認為智力發(fā)育障礙與苯丙氨酸毒性有關(guān)，但更為詳細的病理生理機制仍不清楚。
2.神經(jīng)精神表現 由于有腦萎縮而有小腦畸形，反復發(fā)作的抽搐，但隨年齡增大而減輕。肌張力增高，反射亢進(jìn)。常有興奮不安、多動(dòng)和異常行為。
3.皮膚毛發(fā)表現 皮膚常干燥，易有濕疹和皮膚劃痕癥。由于酪氨酸酶受抑，使黑色素合成減少，故患兒毛發(fā)色淡而呈棕色。
4.其他 由于苯丙氨酸羥化酶缺乏，苯丙氨酸從另一通路產(chǎn)生苯乳酸和苯乙酸增多，從汗液和尿中排出而有霉臭味(或鼠氣味)。
一般而言，臨床表現與PAH基因突變的類(lèi)型與臨床表型的嚴重性相關(guān)，輔因子缺乏比PAH蛋白異常的臨床表型較輕。
本病診斷應強調早期診斷，以便得到早期治療，以避免智力發(fā)育障礙。要得到早期診斷必須在新生兒中進(jìn)行苯丙酮尿癥的篩查。
1.篩查方法 國際上公認的常規篩查方法為Guthrie發(fā)現的細菌抑制法。國內已有PKU篩查試劑盒供應。此方法是根據患兒血對培養的變異性枯草桿菌生長(cháng)帶的大小來(lái)估計血中苯丙氨酸的水平。如果估計的血苯丙氨酸的水平在0.24mmol/L則為陽(yáng)性。此方法可用于出生后3～5天的嬰兒。對有家族史的新生兒更應進(jìn)行新生兒期篩查。
2.苯丙氨酸負荷試驗 此試驗可以直接了解PAH的活性。負荷劑量為口服苯丙氨酸0.1g/kg，連服3天。經(jīng)典的PKU患兒血中苯丙氨酸水平在1.22mmol/L以上，輕型者則常在1.22mmol/L以下，后一種結果提示這些患兒可能是無(wú)PKU的高苯丙氨酸血癥。
3.病因診斷 引起苯丙酮尿癥的基因是PAH基因，病因診斷就是檢測PAH基因突變。PAH基因突變的檢測不僅可以對患者做出病因診斷，而且對胎兒可做出產(chǎn)前診斷。基因型與表型之間在大多數病人中存在相關(guān)性。不同的突變類(lèi)型對PAH活性的影響程度也不相同，因此檢測PAH基因突變對判定預后和指導治療也有指導意義。
檢測PAH基因的突變方法很多，但多以多聚酶鏈式反應(PCR)再聯(lián)合后述檢測方法中的1種或2種，包括單鏈構形多態(tài)性(SSCP)、限切酶片段長(cháng)度多態(tài)性(RFLP)、變性梯度凝膠電泳(DGGE)、DNA直接測序、突變位點(diǎn)特異性寡核苷酸探針(ASO)、PCR-聚丙烯胺凝膠電泳-銀染色、雙脫氧指紋法、擴增不應性突變系(anplification refractory mutation system，ARMS)、酶錯配裂解方法等。可以分析擴增的DNA，也可對RNA進(jìn)行SSCP分析。分析標本用周?chē)馨图毎a(chǎn)前診斷可分析極體(配子產(chǎn)物)。分析極體和ASO可作產(chǎn)前診斷，對已知突變位點(diǎn)的PAH基因也可用ASO方法檢查。我國最常見(jiàn)的PAH基因突變有5種：R243Q、Y204C、V399V、Y356X、R413P，此5種PAH基因突變占56.7%。在突變中以點(diǎn)突變最常見(jiàn)，占突變類(lèi)型中的77.4%。黃尚志提出PAH基因突變的快速診斷程序：第1步作突變點(diǎn)特異性寡核苷酸探針?lè )治觯\斷率可達66%;第2步作外顯子4的SSCP分析，診斷率提高到80%;第3步用SSCP分析法檢測幾個(gè)常見(jiàn)的突變位點(diǎn)即R243Q(外顯子7)、V339V和Y356X(外顯子11)，可使診斷率達到87%。
檢測PTPS基因的方法也是采用以PCR為基礎，結合DGGE方法，可篩選此基因的6個(gè)編碼序列和所有PTPS基因的剪接位點(diǎn)。

經(jīng)典型和輔因子缺乏引起的PKU病人均有高苯丙氨酸血癥，但有高苯丙氨酸血癥者不一定引起PKU，故PKU應與其他高苯丙氨酸血癥者進(jìn)行鑒別。
一過(guò)性高苯丙氨酸血癥雖然引起此癥的病因也是由于PAH有缺陷，但不是由于PAH基因突變，而是PAH未成熟，導致血中苯丙氨酸濃度升高達1.22mmol/L，但隨時(shí)間的推移，血苯丙氨酸濃度可降至正常，通過(guò)隨訪(fǎng)血中苯丙氨酸水平可以鑒別。
轉氨酶性高苯丙氨酸血癥是由于苯丙氨酸轉氨酶缺乏所引起。此癥不引起苯丙酮尿癥，一般情況下血中苯丙氨酸水平正常，只是在進(jìn)食高蛋白飲食時(shí)血苯丙氨酸濃度升高，苯丙氨酸代謝產(chǎn)物水平也正常，故與PKU癥不難鑒別。
輕型PKU也只有高苯丙氨酸血癥與輔因子引起的PKU的鑒別,可通過(guò)基因診斷和測定血中酪氨酸水平或苯丙氨酸負荷試驗測定苯丙氨酸和酪氨酸的比值進(jìn)行鑒別。