不孕
約有50%左右內異癥患者伴有不孕，在不明原因不孕患者中，約30-40%患內異癥。內異癥患有不孕，常因病變造成盆腔腫塊、粘連、輸卵管堵塞卵泡發(fā)育不好或排卵障礙等因素引起;而一旦懷孕則異位內膜受到抑制而萎縮，對內異癥起到很好的治療，習慣性流產(chǎn)病例中有部分為子宮內膜異位癥所致。
痛經(jīng)
內異癥的臨床特征為漸進(jìn)性痛經(jīng)，是常見(jiàn)而突出的特征，多為繼發(fā)性，即自發(fā)生內膜異位開(kāi)始，患者訴說(shuō)以往月經(jīng)來(lái)潮時(shí)并無(wú)疼痛，而從某一個(gè)時(shí)期開(kāi)始出現痛經(jīng)，可發(fā)生在月經(jīng)前、月經(jīng)時(shí)及月經(jīng)后。有的痛經(jīng)較重難忍，需要臥床休息或用藥止痛，甚至痛得“滾炕”或撞頭，疼痛常隨著(zhù)月經(jīng)周期而加重，月經(jīng)結束而消失，但國內報道有21%約無(wú)痛經(jīng)。
周期性直腸刺激癥狀：進(jìn)行性加劇的周期性直腸刺激癥狀罕見(jiàn)于其他婦科疾病，是診斷本癥最有價(jià)值的癥侯。直腸、肛門(mén)、外陰部墜脹、墜痛、里急后重感和大便次數增多。當病變逐漸加重時(shí)，癥狀日趨明顯，而經(jīng)后癥狀消失。
月經(jīng)不調
內異癥患者常有月經(jīng)周期縮短、經(jīng)量增多或經(jīng)期延長(cháng)等現象，說(shuō)明患者有卵巢功能障礙表現。月經(jīng)不調可作診斷參考，但在鑒別診斷中并無(wú)價(jià)值。
性交痛
當存在于陰道穹窿部異位子宮內膜結節、直腸凹陷結節或粘連，或卵巢粘連在盆底時(shí)，均可產(chǎn)生性交痛。闊韌帶后葉病灶纖維化增生及收縮明顯時(shí)，可以外源性壓迫輸尿管，使其狹窄阻塞，亦可能出現泌尿系統癥狀，嚴重的可發(fā)生輸尿管積水或腎盂積水。
周期性膀胱刺激癥狀
當內異癥病變累及膀胱腹膜反褶或侵犯膀胱肌層時(shí)，會(huì )同時(shí)出現經(jīng)期尿急、尿頻等癥狀。若病變侵犯膀胱粘膜(膀胱子宮內膜異位癥)則有周期性血尿和疼痛。
巧克力囊腫經(jīng)期或行經(jīng)前后的急腹癥：一般為卵巢子宮內膜囊腫，有穿破的特點(diǎn)，多數患者因卵巢囊腫扭轉或宮外孕而急診手術(shù)。若不手術(shù)而好轉時(shí)，盆腔粘連加重，今后還會(huì )反復破裂發(fā)生急腹癥。
周期性下腹不適
本癥狀的出現率高于痛經(jīng)，無(wú)痛經(jīng)的內異癥患者常存在于本癥狀。出現于輕癥患者，或某些病變雖較重但由于痛閾的個(gè)性差異或其他原因，不產(chǎn)生痛經(jīng)癥狀而僅有經(jīng)期腰酸、下腹墜脹不適感。
腹壁疤痕及臍部的子宮內膜異位癥則出現周期性局部腫塊及疼痛。內在型子宮內膜異位癥患者往往子宮脹大，但很少超過(guò)3個(gè)月妊娠。如為后位子宮，往往粘連固定。在子宮直腸窩、子宮骶韌帶或宮頸后壁常可觸及1-2個(gè)或更多硬性小結節，如綠豆或黃豆大小，多有明顯的觸痛，肛診更為明顯，這點(diǎn)很重要。卵巢囊腫可長(cháng)至拳大，由于常有囊腫內容物外溢和異位內膜出血，盆腔臟器粘連加重成冰凍盆腔狀，即是所謂廣泛內異癥。病變程度輕重不同時(shí)體征差別很大。
腹膜炎
生長(cháng)在卵巢的巧克力囊腫，囊壁常常很糟脆，具有一種自發(fā)破裂的傾向。囊腫破裂后，小的破口可以很快自行愈合，并與周?chē)M織形成粘連;如果破口較大，則無(wú)法自行愈合，其濃稠的巧克力樣囊內液可流入腹腔，這種巧克力樣液體的刺激性極強，可刺激周?chē)母鼓ぃ饎×业母雇矗绻幚聿患皶r(shí)，還可能導致彌漫性腹膜炎，造成致命的后果。