最常見(jiàn)的并發(fā)癥為腦血栓（系紅細胞增多，血粘稠度增高，血流滯緩所致），腦膿腫（細菌性血栓）及亞急性細菌性心內膜炎，而積極接受手術(shù)治療的患兒，也會(huì )并發(fā)一些術(shù)后并發(fā)癥：
1、肺部并發(fā)癥
F4主要病理變化是右室流出道狹窄和高位巨大室間隔缺損導致右向左分流，肺血流減少， 血液粘稠，氧運送障礙 ，F4影響治療效果的主要因素是肺動(dòng)脈發(fā)育狀況，尤其是左右肺動(dòng)脈分支乃至遠側分支細小者，療效較差，術(shù)前貧血，肺血管及肺重度發(fā)育不良， 血液粘稠和肺血少可致肺泡變性和肺毛細血管微血栓形成，術(shù)中肺血管因側支過(guò)多而過(guò)度充盈， 肺靜脈回流不暢， 形成灌注肺，右室流出道疏通后，肺血大量增加， 術(shù)后肺血灌注量明顯升高，加上嬰幼兒肺及支氣管脆嫩，管腔狹小， 分泌物多，管腔易阻塞， 術(shù)后常出現肺部并發(fā)癥， 而成為F4 術(shù)后早期死亡的主要原因之一，為防止肺部并發(fā)癥，對肺內側支循環(huán)較多者術(shù)中采用深低溫低流量方法，保證左心引流通暢， 以減少側支循環(huán)對肺的灌注，嚴格控制輸液(血) 量和質(zhì)，體外循環(huán)預充時(shí)紅細胞壓積不應低于20%， 膠體滲透壓不低于113kPa，防止肺內滲出，降溫及復溫的溫差不超過(guò)10 ℃，轉流中持續靜態(tài)膨肺及間歇正壓膨肺， 術(shù)后呼吸機PEEP015～ 113kPa，肺部體療，霧化吸入，充分吸痰，有的患兒拔管后可能出現哮喘或喉頭水腫，應及時(shí)給予持續霧化吸入及支氣管擴張劑， 氨茶堿或喘定效果好。
2、完全性房室傳導阻滯
Ⅲ度房室傳導阻滯是F4 根治術(shù)后的常見(jiàn)并發(fā)癥，由于術(shù)中直接創(chuàng )傷，牽拉或縫線(xiàn)位置不當以及術(shù)中低溫， 缺氧缺血等，可導致完全性房室傳導阻滯， 但多為一過(guò)性，經(jīng)復溫及拔除腔靜脈引流管即可恢復竇性心律，無(wú)效時(shí)可用異丙腎上腺素(5μg/ ml) 5～10μg 靜脈注射，可用暫時(shí)性心臟起搏和激素治療。
3、低心排綜合征
多因畸形過(guò)度復雜，手術(shù)畸形糾正不滿(mǎn)意， 室間隔缺損有殘余漏或流出道及肺動(dòng)脈狹窄解除不夠充分， 心室切口過(guò)大損傷右室功能， 主動(dòng)脈阻斷時(shí)間過(guò)長(cháng)，術(shù)中心肌保護差， 左心發(fā)育不全， 常溫下低血壓等因素引起，預防方法是避免上述原因發(fā)生，術(shù)后嚴密觀(guān)察，及早處理，在排除血容量不足或心包填塞等情況下， 可應用硝普鈉等擴張血管藥，并輔以多巴胺，異丙腎上腺素等，以減輕心臟前后負荷， 增強心肌收縮力，控制低心排。
4、滲血出血
F4患者由于側支循環(huán)豐富，凝血機制障礙和體外循環(huán)時(shí)間較長(cháng)等致使術(shù)后滲血機會(huì )增加，除失血量多外還可引起心包填塞， 影響心功能，甚至危及生命，防治方法是盡量縮短體外循環(huán)時(shí)間，嚴密采用ACT監測，手術(shù)結束前仔細止血，術(shù)后保持引流管通暢， 嚴密觀(guān)察引流液量，必要時(shí)及早開(kāi)胸止血。
5、全身毛細血管滲漏綜合征
新生兒及小嬰兒體外循環(huán)后常發(fā)生滲漏現象， 這可能與炎性介質(zhì)釋放，致毛細血管內皮損傷有關(guān)，臨床表現為全身嚴重水腫， 胸腹腔大量滲出， 常需較大劑量的兒茶酚胺類(lèi)藥物和輸入大量膠體液來(lái)維持血壓，目前尚無(wú)有效的預防辦法， 應用激素可能增加毛細血管穩定性， 但不能阻止滲漏發(fā)生，對這類(lèi)患兒要隨時(shí)測定血漿蛋白， 使總蛋白維持在7～8mmol/ L，血紅蛋白12～14mg/ L。