完全性大動脈轉(zhuǎn)位若不伴其他畸形，則形成兩個并行循環(huán)。上、下腔靜脈回流的靜脈血通過右心射轉(zhuǎn)位的主動脈供應(yīng)全身，而肺靜脈回流的氧合血則通過左心射入轉(zhuǎn)位的肺動脈到達肺部。患者必須依靠心內(nèi)交通(卵圓孔未閉、房間隔缺損、室間隔缺損)或心外交通(動脈導(dǎo)管未閉、側(cè)支血管)進行血流混合。本病血液動力學(xué)改變?nèi)Q以是否伴同其他畸形，左右心血液溝通混合程度及肺動脈是否狹窄。根據(jù)是否合并室間隔缺損及肺動脈狹窄可將完全性大動脈轉(zhuǎn)位分為三大類：
(1)完全性大動脈轉(zhuǎn)位并室間隔完整：右心室負荷增加而擴大肥厚，隨正常的肺血管阻力下降，左心室壓力降低，室間隔常偏向左心室。二者僅靠未閉的卵圓孔及動脈導(dǎo)管溝通混合，故青紫、缺氧嚴重。
(2)完全性大動脈轉(zhuǎn)位合并室間隔缺損：完全性大動脈轉(zhuǎn)位伴室間隔缺損可使左右心血液溝通混合較多，使青紫減輕、但肺血流量增加可導(dǎo)致心力衰竭。
(3)完全性的動脈轉(zhuǎn)位合并室間隔缺損及肺動脈狹窄：血液動力學(xué)改變類似法洛四聯(lián)癥。