IL2RA-RBM17基因區(qū)域單核苷酸多態(tài)性與中國蒙古族白癜風關聯(lián)研究
白癜風是一種色素脫失性皮膚病,近年遺傳關聯(lián)研究發(fā)現(xiàn),一大批白癜風相關的易感基因中IL2RA-RBM17基因在歐洲及中國漢族人群的研究中均有報道。烏日娜等選擇位于IL2RA-RBM17基因區(qū)域的9個單核苷酸多態(tài)性(SNP),用連接酶鏈反應(LDR)對其進行基因分型,探討IL2RA-RBM17基因區(qū)域多態(tài)性與蒙古族白癜風的相關性。
方法
收集白癜風患者425例,健康對照503例。用AxyPrep(AP-MX-BL-GDNA-25)基因組DNA抽提試劑盒抽提基因組DNA。選擇位于IL2RA-RBM17基因區(qū)域的9個單核苷酸多態(tài)性(rs706779、rs3134883、rs7090530、rs12251307、rs4750005、rs3920615、rs4747887、rs4750012、rs7099083),用連接酶鏈反應進行基因分型。比較白癜風組及健康對照組等位基因頻率及基因型頻率,對5個差異有統(tǒng)計學意義的SNP間進行連鎖不平衡檢驗,并分析每個單倍型頻率在白癜風組和健康對照組中的分布。
結果
5個SNP(rs4750005、rs3920615、rs4747887、rs4750012、rs7099083)的等位基因頻率與健康對照組差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。5個SNP在顯性遺傳模式下,白癜風組中的基因型頻率均顯著低于健康對照組(P<0.0056)。5個差異有統(tǒng)計學意義的SNP間存在中等至強的連鎖不平衡(D′=0.424~1,r2=0.137~0.985)。用5個具有相關性的SNP構建單倍型,分析每個單倍型頻率的分布,發(fā)現(xiàn)1個單倍型(H2:CGCTA)在白癜風組頻率明顯低于健康對照組,并達到Bonferroni校正水平(P=0.0016,OR=0.674)。
結論
IL2RA-RBM17區(qū)域基因多態(tài)性與蒙古族白癜風具有相關性。